21 Ocak 1962'de İstanbul Üsküdar’da dünyaya geldi.
12 Eylül Darbesi’nden öncesindeki karışık zamanda siyasî olaylar içinde bulundu. Bu eylemler yüzünden henüz on sekiz olmadan iki kez hüküm giydi, siyasi tutuklu olarak cezaevine girdi ve yaklaşık dört yıl boyunca cezaevinde kaldı.
İlk yazılarını Hergün gazetesinde Taş Medreseden Mektuplar başlığıyla yayımladı. Dücane Cündioğlu Arapça, İngilizce, Almanca, Fransızca, İbranice bilmektedir. 70'li yılların sonlarında cezaevinde başladığı yazı hayatına, tekrardan çeşitli dergi ve gazetelerde makaleler yayımlayarak başladı. 1985 yılından itibaren yayıncılıkla uğraştı.
5 Şubat 2011 tarihinde, on üç yıl boyunca Yeni Şafak gazetesinde sürdürdüğü köşe yazarlığına son verdi. Büyükada'da herkesten uzaklaşarak inzivaya çekildi.
2 Nisan 1980’den itibaren yayımlamaya başladığı ilk yazıları dinî bilimler ve bu bilimlerin modern eleştirileri üzerineydi. İlerleyen zamanlarda ise din ve bilim, din ve siyaset ilişkilerini konu edindiği incelemelerinin yanında bazı monografiler de yayımlamıştır, teoloji, tasavvuf, tarih, edebiyat, sinema çeviri, sanat, mimarlık, psikoloji, felsefe gibi farklı dallardaki ele aldığı konuları kaleme almıştır. İlerleyen zamanlarda ise bu denemelerini derleyerek kitap haline getirmiştir.
