Mehmet Emin Onat, 1908 yılında İstanbul'da doğdu. Onat'ın mimarlık kariyeri, 1930'larda Yüksek Mühendis Mektebi'nde gösterdiği üstün başarılarla başladı. Zürih Teknik Üniversitesi'nde Otto Rudolf Salvisberg’in öğrencisi olarak eğitim aldıktan sonra 1934 yılında birincilikle mimarlık bölümünden mezun oldu. Türkiye'ye döndükten sonra, Yıldız Teknik Üniversitesi için önemli projelerde yer aldı ve 1944'e kadar yönettiği bağımsız Mimarlık bölümünü kurdu.
Emin Onat, 1941 yılında Anıtkabir için düzenlenen uluslararası yarışmada Mimar Ahmet Orhan Arda ile birlikte yer aldı ve hazırladıkları proje birincilikle ödüllendirildi. Bu proje, 1944-1953 yılları arasında gerçekleştirilen Anıtkabir projelerinin düzenlenmesi ve inşaat kontrolünü üstlendiği bir sürecin başlangıcını oluşturdu.
1944 yılında Yüksek Mühendis Mektebi'nin İstanbul Teknik Üniversitesi'ne dönüştürülmesiyle birlikte oluşturulan Mimarlık Fakültesi'nin ilk dekanlığına seçilen Onat, aynı zamanda İngiliz Mimarları Kraliyet Enstitüsü (RIBA) onursal üyesi olarak seçilmiştir.
1950-1953 yılları arasında İstanbul Teknik Üniversitesi'nin rektörlüğünü üstlenen Emin Onat, Türk Mimarisi’ni ve Türk Mimarlarını uluslararası alanda temsil etmiştir. 1953 yılında Uluslararası Mimarlar Birliği'nin Türkiye bölümünü kurarak önemli bir adım attı.
Yıldız Teknik Okulu Binası, Ankara Atatürk Anıt-Kabir, İstanbul Üniversitesi Fen ve Edebiyat Fakülteleri, Bursa Uludağ Sanatoryumu, ve İstanbul Sanayi Kalkınma Bankası binası.
Mehmet Emin Onat, 17 Temmuz 1961 tarihinde geçirdiği kalp krizi sonucunda yaşamını yitirmiş ve aramızdan ayrılmıştır.